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Renewal 2006.6.19
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■2008年05月25日（日）
自宅PCクラスタ ヘテロ編その1
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先日の ML115クラスタにヘテロジニアスなノードを増築してみました。
メインPCとファイルサーバを一時止めて、クラスタに組み込みました。
この二つのプロセッサは、ML115に同じくAthlon64ですが、
デュアルコアってこととクロックが異なります。
OpenMPIのヘテロジニアス環境下の性能評価、第一弾です。
構成
●ML115クラスタ（4ノード）
CPU: Athlon64 3500+ 2.2GHz
MEM: 2GB
●ファイルサーバ（ML115）
CPU: Athlon X2 BE-2300 1.9GHz (Brisbaneコア)
MEM: 2GB
●メインPC（組立PC/AT互換機）
CPU: Athlon64 X2 4400+ クロックアップ2.42GHz (Toledoコア)
MEM: 2GB
以上を、1000BASE-Tで繋いで、
6ノード、8コアのヘテロジニアス・クラスタ。
設定も簡単で、ホストに追加するだけ。
結果
■ qn24b_mpi 18-Queens
ML115クラスタ: 94.933 [sec]
クロック・ヘテロ: 48.135 [sec]
■ 姫野ベンチ cc_himenoBMTxp_mpi
ML115クラスタ: 3737.781736 [MFLOPS] (Lサイズ)
クロック・ヘテロ: 5605.110826 [MFLOPS] (Lサイズ)
■ HPCC HPL
ML115クラスタ: 12.9427 [GFLOPS] (N=17500, N=100) hpcc result
クロック・ヘテロ: 21.5296 [GFLOPS] (N=23000, N=100) hpcc result
とゆーわけで、それなりの性能向上が得られました。
ヘテロと言ってもクロックに大きな差はないですし、
マルチコア上でもOpenMPIはそれなりの性能は出るようです。
OpenMPI良いわー | | |
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■2008年05月21日（水）
HP 2133 Mini-Note PC 発表
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■2008年05月11日（日）
自宅PCクラスタ
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GWと今週末を使って、ML115でPCクラスタを組んでベンチマーク。
今回は、並列計算環境としてOpenMPIを用いました。
これまでは、MPICHとSCoreしか使ったことなかったのですが、最近流行ってるらしいので。
ML115とDebianGNU/Linuxで構築したときのメモ
http://rian.s26.xrea.com/file/ml115clustermemo.txt
さて、ベンチマーク。
今回は並列計算用ベンチマークとして、qn24b、姫野ベンチ、HPCCをやってみました。
初期状態のML115と、4ノードからなるクラスタと対決です。
クラスタノードのML115は、初期状態からメモリだけが違い、
DDR-667の512MB(ECC付き)1枚から、DDR-800の2GB(ECCなし)1枚になってます。
CPUはAthlon64 3500+ 2.2GHzのまま。
ネットワークは1000BASE-T。
GCCは4.1.2、行列演算はATLAS 3.8.1。
■ qn24b_mpi 18-Queens
ML115: 374.996 [sec]
クラスタ: 94.933 [sec]
3.9倍高速に。
■ 姫野ベンチ cc_himenoBMTxp_mpi
ML115: 800.180033 [MFLOPS] (Sサイズ)
クラスタ: 3737.781736 [MFLOPS] (Lサイズ)
4.7倍高速に。
■ HPCC HPL
ML115: 3.35659 [GFLOPS] (N=7500, NB=80) hpcc result
クラスタ: 12.9427 [GFLOPS] (N=17500, N=100) hpcc result
3.8倍高速に。
姫野ベンチが4倍以上速くなったのはメモリと問題サイズの影響だろうね。
他二つもなかなかの効率の良さ。
HPLは、メモリ増えた分もう少しがんばって欲しいな、パラメタをもう少しいじれば。
今後は、メモリ増設、CPU交換、冗長化ネットワーク、ヘテロジニアス構成だな。
あと、OpenMPIとMPICHのパフォーマンス比較。
半年は遊べそうです。
研究室時代に使ってたクラスタが、
HPLで75GFLOPS、18-Queensで22秒だったので、
これを目標に改修していきます。
# 5/25 update: qn24bとHPLの結果を取り直し | | |
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■2008年05月07日（水）
Wii で Linux
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 | GWももう終りだよ、また会社か。。。
さて、今日はWiiでLinuxを動かしてみました。
WiiでLinuxを動かすには、トワイライト・ハックしてLinuxを読み込むだけ。
特別必要なものは、ゼルダの伝説トワイライトプリンセスくらい。
現時点のWii本体(3.2J)やゼルダ(RVL-RZDJ-0A-0)のバージョンでハックできるので、
Xbox360と違って楽で助かります。
トワイライト・ハックのやり方については、2chとかまとめwikiへどうぞ。
http://game14.2ch.net/test/read.cgi/gameurawaza/1208517877/l50
http://www9.atwiki.jp/wiihack/pages/1.html
Wii用のLinuxは以下から落とせます。
https://sourceforge.net/project/showfiles.php?group_id=98581&package_id=264419
この中のelfをトワイライト・ハックなり適当なローダからブートするだけ。
現時点での最新バージョンはv0.4でして、
このバージョンから、WiiのUSBポートを利用してキーボードが使えます。
ちなみに、v0.3からはWii前面のSDカードスロットも使えまして、
# mount /dev/rvlsda1 /media/slot0
でマウントできます。
とゆーわけで、いつもの。
dmesg
cpuinfo
meminfo
version
CPUクロックはやはり729MHzのようですね。
ホントの値かどうかは知らないですけど。。。
bogomipsが121.34ってのはクロックに比べ小さい気がするな。
さて、ベンチマークしたくなるわけです。
v0.4では、セルフコンパイル環境はありません。
クロスコンパイル環境が必要になりそうですが、そこはLinuxの良いとこ！
PPC×Linux環境が別にあれば問題ないわけです、そうぼくらにはPS3がある！
（WiiのCPU"Broadway"はPPC系）
とゆーわけで、PS3上でコンパイルして、SDカードに移して、
Wii上で実行、もちろん動作しました。
PS3 OS: Ubuntu 7.10
Wii OS: Wii-linux PoC 0.4
コンパイラ: GCC 4.1.3
最適化オプション: -O3
※PS3はPPEのみ1スレッド
※実行は共に同じバイナリを使用
■ Dhrystone [DMIPS] (整数演算)
PS3: 1986
Wii: 1418
■ 単精度Whetstone [MWIPS] (浮動小数点演算)
PS3: 1148
Wii: 1254
■ 倍精度Whetstone [MWIPS] (浮動小数点演算)
PS3: 1278
Wii: 1145
汎用的なプログラムはPS3にとっては苦手で（インオーダ、深いパイプライン）、
WiiはPS3のPPEとは異なるアーキテクチャなので（アウトオブオーダ、浅いパイプライン）、
クロックの割りにWiiが善戦してるというかPS3が遅いのか。
Broadwayは750CLがベースらしいという話だったので、
コンパイルオプションに -mcpu=750 を付けてみましたが、
Dhrystoneで 1379DMIPS と若干遅くなってしまいました。
Whetstoneは変化無し。
やっぱり中身はちょっと違うのだろうな。
Wii-linuxは、あとはネットワークに対応してくれるともっと遊べそうなんだけどな。
つか、Xbox360でのLinux動作がもっと簡単にならないものかね。 | | |
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■2008年05月05日（月）
メモリ買ったですよ
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 | メモリ買いました。ML115に載せる用です。
UMAXの4GBセットを2つ。2GBを1枚づつ4台のML115に載せるつもりです。
デュアルチャンネルじゃないのはどうかなとmemtestで速度見てみました。
環境は、
HP ML115
Athlon64 3500+ 2.2GHz
DDR2-800 5-5-5-15
Memtest-86 v3.4
1枚(2GB): 2263MB/s
2枚(4GB)デュアルチャンネル無し: 2864MB/s
2枚(4GB)デュアルチャンネル有り: 3183MB/s
4枚(8GB): 3437MB/s
デュアルチャンネルによって1割以上速度向上してる。
よし、今度またメモリ増設しよう。
さて、ML115と64bitLinuxでメモリ8GB認識できました。
Linuxは、Debian GNU/Linux 4.0r3 AMD64。
meminfo
8GBもメモリあって、さて何に使うのかしらね。 | | |
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■2008年05月03日（土）
Bluetoothレーザーマウス
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