ML115でPCクラスタ
Systems: HP ML115 G1
OS: Debian GNU/Linux 4.0 AMD64

目的：rshを用いたOpenMPIによる並列計算機構築

サーバホスト、計算ホスト共に以下を1〜6までやる


1. OSインストール
・Debianインストール
netinstディスクから、ベースシステムのみをインストールした

・/etc/apt/source.list からCDをはずす

・必要ならやる
  ・Wake on LAN 設定)
  ・SSHインストール)
  ・ユーザアカウント作成)


2. IPアドレス設定
/etc/network/interfaces を編集。

例）
iface eth0 inet static
address 192.168.0.2
network 192.168.0.0
netmask 255.255.255.0
broadcast 192.168.0.255
gateway 192.168.0.1
auto eth0

設定後、ネットワーク再起動
/etc/init.d/networking restart


3. コンパイラインストール
 # apt-get install gcc g77 make libc6-dev


4. rshインストール
 # apt-get install rsh-server
 /etc/hosts.equiv に全ホストを追加

※もしrootでやもやるなら
  /root/.rhosts にホストを追加
 # echo rsh > /etc/securetty


5. OpenMPIインストール
 # apt-get install openmpi-bin openmpi-dev


6. NFS設定
ユーザローカルディレクトリと、
OpenMPIの設定ディレクトリ(/etc/openmpi)をNFSで共有する

・サーバホストの場合
 # apt-get install nfs-kernel-server
 /etc/exports を編集

・計算ホストの場合
 /etc/fstab を編集


7. OpenMPIの設定(サーバホストのみ)
/etc/openmpi/openmpi-default-hostfile に計算に用いるホスト名を記述

/etc/openmpi/openmpi-mca-params.conf に、rshを使う設定を記述
 # echo "pls_rsh_agent=rsh" >> /etc/openmpi/openmpi-mca-params.conf


8. 実行
 $ mpiexec -n 8 ./hoge


※もし実行後↓と言われたら
OpenIB on host tux was unable to find any HCAs. 
Another transport will be used instead, although this may result in 
lower performance. 

 # echo "btl=^openib" >> /etc/openmpi/openmpi-mca-params.conf